SALA 1
Sala 1: Iconografía y libros antiguos
Esta sala conserva algunos recuerdos del tiempo de los estudiantes del seminario menor, fotos de los rectores, altares antiguos, registros fotográficos de los grupos de estudio y un retrato de San Juan Gabriel Perboyre. Además, conserva una colección de libros antiguos que los misioneros franceses trajeron desde 1870 a Colombia.
Recorre la sala 1 del Museo de los Misioneros Vicentinos
SALA 2
Sala 2: Historia provincial y arte sacro
En esta sala del museo se conservan recuerdos antiguos del santuario, un sagrario, órganos utilizados en la animación litúrgica del lugar e imágenes de la Virgen Milagrosa.
Además el visitante podrá apreciar el mural que contiene los detalles del viaje y la llegada de los lazaristas franceses a Colombia (1870), una colección de piezas arqueológicas, reliquias como la de la verdadera cruz de Cristo, y piezas de arte sacro.
Recorre la sala 2 del Museo de los Misioneros Vicentinos
SALA 3
Sala 3: Historia Apostólica y Santuario Virgen Milagrosa
Esta sala evoca la historia de la Escuela Apostólica, fundada en 1894: muebles, fotografías, objetos de la casa. Se encuentra también un meteorito que fue traído desde Boyacá a esta casa en 1942. También una colección de Medallas de la Virgen Milagrosa.